En ocasiones, la actividad de los hemisferios Norte y Sur puede llegar a ser muy diferente, predominando uno y otro según reglas aún no comprendidas. Cualquier análisis de la actividad resulta incompleto si no considera esta circunstancia. La asimetría se manifiesta no sólo en el número de manchas o en su superficie, sino también en las fulguraciones , protuberancias , fáculas , campos magnéticos fotosféricos, viento solar , etc. Lo interesante es que existe una coherencia en todos estos aspectos, es decir, cuando un hemisferio predomina lo hace, generalmente, en todas las facetas de actividad.

La existencia de una asimetría N-S suele provocar un desfase entre ambos hemisferios a lo largo del ciclo de manera que uno de ellos puede alcanzar el máximo uno o dos años antes que el otro. Una característica, a la vez fascinante y enigmática, es que desde el ciclo Nº12 (en torno a 1875) este desfase sigue un comportamiento periódico: en los ciclos N os 12-13-14-15 el hemisferio Norte llegó antes al máximo, en los N os 16-17-18-19 lo hizo en Sur, y en los tres siguientes (N os 20-21-22) volvió a adelantarse el Norte. 

En la gráfica se representa el índice de asimetría (A) calculado para el promedio anual de las áreas de manchas, desde 1878 hasta la actualidad. El índice de asimetría se define como 

A = (N-S) / (N+S)

donde N y S son cualquier característica de la actividad solar en los hemisferios Norte y Sur (un valor positivo representa predominio del Norte). Cada color representa un ciclo, aunque no es raro que el cambio en la asimetría se adelante un año. Esto probablemente se deba al periodo de superposición de dos ciclos consecutivos. Las líneas rectas son un ajuste lineal de los datos de cada ciclo, de manera que se aprecie mejor el cambio de la pendiente.

Durante el ciclo actual (Nº 23) el hemisferio Norte alcanzó el máximo en Octubre de 2000, y el Sur en Febrero de 2002. Por tanto, se repite el comportamiento de los últimos tres ciclos. ¿Se mantendrá el comportamiento periódico invirtiéndose la asimetría el próximo ciclo?

Fijémonos también, que un período que abarca 8 ciclos undecenales es muy similar al discutido ciclo de 80-90 años sugiriendo una posible relación entre ambos.